เนื่องจากไฟล์ที่จัดทำด้วย iThesis Add-in เวอร์ชันเก่า ไม่สามารถใช้งานร่วมกับ iThesis Office Add-in เวอร์ชันใหม่ได้ ในการใช้งาน iThesis Office Add-in ที่รองรับการใช้งานบน Microsoft Word ทั้งบนระบบปฏิบัติการ Windows และ Macbook จะมีแนวทางในการย้ายดังนี้
1. เปิด Microsoft Word โดยเปิดหน้าเอกสารเปล่า
2. ติดตั้ง iThesis Office Add-in ผ่าน Microsoft Office Store ทำการเข้าสู่ระบบให้เรียบร้อย
3. ตั้งค่าหน้ากระดาษให้ถูกต้องตามรูปแบบของวิทยานิพนธ์ โดยตั้งขนาดกระดาษเป็น A4 และขอบกระดาษดังนี้ ซ้าย 1.5 นิ้ว (3.81 ซม.), บน 1.5 นิ้ว (3.81 ซม.), ขวา 1 นิ้ว (2.54 ซม.), ล่าง 1 นิ้ว (2.54 ซม.)
4. กด Generate template รอจนโปรแกรมทำงานเสร็จ โดยหากผู้ใช้งานกรอกข้อมูลชื่อหัวข้อวิทยานิพนธ์ คณะกรรมการสอบ บทคัดย่อ คำสำคัญ กิตติกรรมประกาศ ประวัติผู้เขียน ที่ electronic form แล้ว เทมเพลตจะดึงข้อมูลดังกล่าวมาแสดงโดยอัตโนมัติ ยกเว้น ประวัติผู้เขียน ที่ผู้ใช้งานจะต้องมากรอกด้วยตนเองที่เทมเพลตที่สร้างจาก iThesis Office Add-in โดยในส่วนของบทคัดย่อและกิตติกรรมประกาศ สามารถปรับขนาดและการจัดรูปแบบตัวอักษรได้เลยโดยตรงที่เอกสาร
iThesis Office Add-in จะไม่เชื่อมโยงกับเมนู Electronic Form เมนูย่อย Template Settings โดยการปรับขนาดของข้อความจะสามารถปรับได้เองที่เอกสาร ยกเว้นส่วนที่ระบบมีการป้องกันไม่ให้แก้ไขได้ จะต้องปรับที่ style ของ Microsoft Word ที่ผูกกับหน้าเทมเพลตนั้น ๆ
5. เมื่อจัดส่วนของเทมเพลตเรียบร้อยแล้ว ให้ไปยังหน้าที่ 1 เพื่อเริ่มวางเนื้อหา โดยจะมีจุดสังเกตคือ มีคำว่า "เริ่มวางบทที่ 1 ที่นี่" หรือสำหรับบางมหาวิทยาลัยบริเวณดังกล่าวอาจเป็นคู่มือใช้งานที่มีการกำหนดหัวข้อเรียบร้อยแล้ว สามารถลบส่วนของคู่มือออกและวางเนื้อหาลงไปได้
6. เปิดไฟล์วิทยานิพนธ์ที่จัดทำด้วย iThesis Add-in เดิม ให้ Copy เนื้อหาจากไฟล์เดิม โดยสามารถ Copy ทีเดียวทั้งหมด หรือสามารถ Copy ทีละ 1 บทแล้วนำมาวางที่เทมเพลตที่สร้างจาก iThesis Office Add-in
7. หากมีการจัดทำ Heading หรือหัวข้อแล้ว โดยเป็นการใช้ Style ชื่อ Heading เอง หรือ iThesis index ที่รองรับการทำสารบัญอัตโนมัติ สามารถไปยังหน้าสารบัญ จากนั้นคลิกขวาที่ส่วนของสารบัญ (จะแสดงเป็นสีเทา) และเลือก update field จากนั้นจะมีหน้าต่างเปิดขึ้นมา ให้เลือก update entire table เป็นการอัปเดตหัวข้อสารบัญที่ได้จัดทำหัวข้อไว้ที่เนื้อหาแล้ว
หากผู้ใช้งานมีหน้าเอกสารแนวนอน ให้ตั้งค่าขอบกระดาษของหน้าแนวนอนดังนี้ ขนาดกระดาษ A4 ขอบกระดาษดังนี้ ซ้าย 1 นิ้ว (2.54 ซม.), บน 1.5 นิ้ว (3.81 ซม.), ขวา 1.5 นิ้ว (3.81 ซม.), ล่าง 1 นิ้ว (2.54 ซม.)
8. สำหรับสารบัญรูปและสารบัญตาราง ให้ใช้วิธีการ insert caption ที่อยู่ภายใต้เมนู References เพื่อจัดทำรูปและตารางที่เรียงเลข และรองรับการทำสารบัญรูปและสารบัญตารางอัตโนมัติ
9. หากผู้ใช้งานมีการจัดทำรายการอ้างอิงด้วยโปรแกรม Endnote หรือ Zotero แล้ว โดยเป็นการจัดทำในรูปแบบ intext citation (การอ้างอิงที่เนื้อหา) ให้ดำเนินการดังนี้
9.1 สำหรับผู้ใช้งาน Endnote ให้กด update citation ที่เมนู Endnote บน Microsoft Word โปรแกรมจะสร้างรายการอ้างอิงไว้ที่หน้าสุดท้ายของเล่มวิทยานิพนธ์ โดยอยู่หลังจากหน้าประวัติผู้เขียน ให้ผู้ใช้งานเลือกรายการอ้างอิงทั้งหมดที่ถูกข้างขึ้น จากนั้นกด ctrl + X หรือคลิกขวาเลือก cut และมาที่หน้าบรรณานุกรม หรือหน้ารายการอ้างอิง ทำการวางรายการอ้างอิงที่หน้านี้
9.2 สำหรับผู้ใช้งาน Zotero ให้มาที่หน้าบรรณานุกรม หรือหน้ารายการอ้างอิง กดที่บริเวณที่ต้องการวาง จากนั้นกดที่แถบเครืองมือ Zotero บน Microsoft Word เลือกคำว่า Add bibliography เป็นการวางรายการอ้างอิงเต็มที่บริเวณดังกล่าว
แนะนำให้จัดทำรายการอ้างอิงด้วย Reference Manager เพื่อให้ได้รูปแบบที่ถูกต้อง โดยมีข้อแนะนำให้ใช้งาน Mendeley Cite เนื่องจากเทมเพลตที่สร้างจากระบบไอทีสิสจะได้จัดทำให้รายการอ้างอิงเต็มแสดงที่หน้าบรรณานุกรม หรือหน้ารายการอ้างอิง แล้ว เมื่อผู้ใช้งานทำการ insert citation ลงในเนื้อหาโดยใช้ Mendeley Cite รายการอ้างอิงเต็มจะถูกสร้างที่หน้าบรรณานุกรมทันที
10. กด validate template เพื่อตรวจสอบข้อมูลวิทยานิพนธ์ส่วนที่เชื่อมโยงกับข้อมูลที่กรอกที่เมนู electronic form หากโปรแกรมพบว่า มีข้อมูลที่ไม่ตรงกันจะแสดงรายการที่ไม่ตรงกัน ผู้ใช้งานสามารถกด update all ได้ เพื่อทำให้ข้อมูลที่บันทึกบนระบบเป็นปัจจุบันเช่นเดียวกับที่เอกสารวิทยานิพนธ์
11. กด save to cloud เมื่อต้องการบันทึกไฟล์เข้าสู่ระบบ โปรแกรมจะตรวจสอบรูปเล่มอีกครั้ง และจะมีหน้าต่างปรากฏให้กดปุ่ม save จากนั้นรอสักพักจนโปรแกรมทำงานเสร็จและมีรายการที่อัปโหลดปรากฏที่ Revision
หากทำถึงขั้นตอนนี้แล้วแสดงว่าผู้ใช้งานได้ย้ายมาใช้งาน iThesis Office Add-in เรียบร้อยแล้ว
วิธีการนี้ก็สามารถใช้กับการย้ายไฟล์ที่จัดทำด้วย iThesis Office Add-in เองได้ด้วยเช่นกัน เนื่องจากเทมเพลตมีการกำหนดว่าไม่ให้แก้ไขเนื้อหาบางส่วน จึงไม่สามารถกด ctrl + A เพื่อเลือกทั้งหมดได้